
◎ 金凤 通讯员 姜晨 姜佳彤
115例新式冠状病毒感染儿童的临床特色剖析、武汉同济医院医务人员2019新式冠状病毒感染相关要素的病例对照研讨、洛匹那韦/利托那韦对新式冠状病毒肺炎患者血脂水平的影响……3月26日,记者从我国药科大学得悉,该校根底医学与临床药学学院2018级药理学专业博士生孙庆荣带领团队成功开宣布一个冠状病毒资源数据库。该数据库渠道整合了1.2万余篇中外有关冠状病毒的相关文献材料索引信息、病毒相关数据以及病毒研讨相关剖析东西,相关文献跨过50多年的研讨,团队历时32天攻关完结。
录入50余年来的冠状病毒相关文献信息
翻开冠状病毒资源数据库网站,有关冠状病毒研讨的文献、专利、数据资源一望而知。我国药科大学根底医学与临床药学学院2018级药理学专业博士生孙庆荣介绍,数据库中的研讨报告和总述性论文,从1965年跨过至2020年,能够便利广阔学者快捷、敏捷地查找包含新冠病毒在内的冠状病毒的相关研讨文献,深化了解冠状病毒的来历、研讨前史、研讨进程、研讨热门等,促进药学、化学、生物学等多学科的穿插交融。
“这些海量的文献研讨材料,数据库没有照单全收,咱们剔除了一些评论性以及策略性文章,只保留了学术研讨、学术总述、病例解析、数据渠道、剖析东西等内容,以更好地会集有用学术资源。”孙庆荣说,冠状病毒资源数据库从树立到完善只是才32天,到3月22日,数据库里共收集了9556篇英文研讨文献、3052篇中文研讨文献的索引信息,25个英文数据资源渠道、6个中文数据资源渠道以及18个与病毒学相关的首要剖析东西等等。
为何开发创立冠状病毒资源数据库?孙庆荣坦言,这一开发创意首要来历于导师、我国药科大学校长来茂德。疫情发生后,来茂德从医药大数据的视点鼓舞学生们多进行新冠病毒的相关研讨,包含根底的多序列比对、进化剖析以及新冠病毒重要靶点ACE2蛋白的剖析等。
将继续更新数据库资源
说干就干,孙庆荣敏捷与我国药科大学药学、临床药学、中药学、生物制药等多个专业的11位情投意合的本科生组成团队,我们一同查阅文献、收拾材料、树立网站……
孙庆荣坦言,冠状病毒资源数据库的树立,好事多磨。数据库服务器根底环境的构建、数据整合、信息展现等环节,都曾遇到过各式各样的困难。
“数据库服务器根底环境建造需求相关专业技术人员才干完成,数据的整合需求人工检索、挑选,作业量巨大。还有一些图书馆资源的问题,也需求专业技术人员的协助。除此之外,疫情期间均需求各自居家作业,因为团队成员家庭网络的差异,我们的网络最优时段也不同,和谐一致会有点难度。”孙庆荣说。
不过,办法总比困难多,面临许多难题。国内资源数量相对少,他们就选用人工检索为主的办法逐个查找我国知网和万方数据库的文献;关于国外资源,他们选用API和人工检索相结合的办法,完成数据的整合及入库。
研制期间,数据库还得到该校图书与信息中心教师们的辅导、支撑。“团队的树立、根底环境构建、数据库的测验,若是没有教师们的协助,底子完不成。”
孙庆荣说,未来,团队还将不断更新数据库资源,参加更多数据剖析以及与冠状病毒相关药物的数据资源。
来历:科技日报 文中图片均由作者供给
修改:岳靓
审阅:朱丽
终审:冷文生